Ja, das ist kein Problem. Sowohl beim Kalträuchern als auch beim Heißräuchern kannst Du beides im gleichen Ofen zubereiten. Es gibt zwar anders lautende Meinungen, aber die überwiegende Mehrheit der Räucherfreunde kann nicht feststellen, dass der Geschmack des einen zum anderen übergeht. Mancher räuchert sogar beides gleichzeitig im selben Ofen.
Vorsicht ist natürlich geboten, wenn Fisch und Fleisch übereinander hängen. Insbesondere beim Heißräuchern wird es tropfen. Wenn dann etwas vom Fisch auf dem Fleisch landet (und umgekehrt), wird natürlich auch der Geschmack übertragen.